ad 1)
Zdá se, že máte pravdu. V abstraktu se opravdu sází patkově i když okolní text je bezpatkový, i když se před příkazem \zk vynutí změna fontu. Na vině je použitý balíček acronym, který při sazbě používá změnu fontu příkazy \acsfont, \acffont a \acfsfont s pevně nastavenými fonty. Jako rychlou opravu doporučujeme vložit před \begin{document} v hlavním souboru sablona-prace.tex příkazy
\renewcommand*{\acsfont}[1]{#1}
\renewcommand*{\acffont}[1]{#1}
\renewcommand*{\acfsfont}[1]{#1}
Potom uvedené příkazy neprovedou žádnou činnost a zkratka (i rozvinutý text) budou ovlivněny vnějšími příkazy pro změnu fontu a tedy budou vysázeny fontem okolního textu.